Apertura salió séptimo pero muy lejos del campeón. Por su parte en el Clausura, se ubicó séptimo, a seis puntos del primero, redondeando un buen campeonato, en el mismo tuvo una gran arremetida final, en la que ganó los últimos cinco partidos y clasificó a la Copa Libertadores 2001, equipacion de futbol niños al conseguir la quinta posición de la tabla acumulada. Luego de esto Santa Fe recibiría su primera derrota de la temporada como visitante, contra el que sería la postre el líder del torneo en su fase todos contra todos, el Deportes Tolima; por marcador de 2-1. Luego obtiene su primera victoria del año, contra el que sería al final el colero de la tabla, el Cúcuta Deportivo.
